PTAR Mosquera es una de las plantas de tratamiento de aguas residuales proveniente de la ciudad que lleva su nombre para poder verter el agua tratada en el rio Subachoque que cruza por el departamento de Cundinamarca.
El proceso de tratamiento parte desde la llegada del agua servida y pasa por diferentes etapas que garantizan el correcto tratamiento antes de verter el agua al rio: Desbaste de gruesos, desarenado, tratamiento biológico, decantación secundaria, recirculación, purga y deshidratación de fangos.